Jag är inte säker - Du får nog fråga programmerarna om du vill ha ett 100-procentigt svar.
Men jag skulle tro att det är avsiktligt. Antagligen är vitsen att globala moderatorer inte ska ha mer "makt" än vad vanliga moderatorer har, förutom att det gäller på alla tavlor. Att globala moderatorer skulle ha mer makt än så kan tänkas vara en säkerhetsrisk, plus att gränsen då börjar att suddas ut mellan globala moderatorer och administratörer.
Så spontant tycker jag att beteendet i YaBB SE är det rätta, och att CGI-versionen i så fall gör fel.
Därmed inte sagt att det nödvändigtvis är resonemanget bakom programmeringsteamet...